そういえば，ubuntuを8.10から9.04にアップグレードしたら 

sudo aptitude update

で以下のような警告がでるようになった． 

W: Duplicate sources.list entry http://jp.archive.ubuntu.com jaunty/universe Packages (/var/lib/apt/lists/jp.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty_universe_binary-i386_Packages)
W: Duplicate sources.list entry http://jp.archive.ubuntu.com jaunty/universe Translation-ja (/var/lib/apt/lists/jp.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty_universe_i18n_Translation-ja)
W: Duplicate sources.list entry http://jp.archive.ubuntu.com jaunty/multiverse Packages (/var/lib/apt/lists/jp.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty_multiverse_binary-i386_Packages)
W: Duplicate sources.list entry http://jp.archive.ubuntu.com jaunty/multiverse Translation-ja (/var/lib/apt/lists/jp.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty_multiverse_i18n_Translation-ja)
W: Duplicate sources.list entry http://jp.archive.ubuntu.com jaunty-updates/universe Packages (/var/lib/apt/lists/jp.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty-updates_universe_binary-i386_Packages)
W: Duplicate sources.list entry http://jp.archive.ubuntu.com jaunty-updates/multiverse Packages (/var/lib/apt/lists/jp.archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty-updates_multiverse_binary-i386_Packages)
W: Duplicate sources.list entry http://security.ubuntu.com jaunty-security/universe Packages (/var/lib/apt/lists/security.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty-security_universe_binary-i386_Packages)
W: Duplicate sources.list entry http://security.ubuntu.com jaunty-security/multiverse Packages (/var/lib/apt/lists/security.ubuntu.com_ubuntu_dists_jaunty-security_multiverse_binary-i386_Packages)
W: これらの問題を解決するためには apt-get update を実行する必要があるかもしれません

で，/etc/apt/source.listをみたら重複箇所があったので，それを除外したら，警告が消えた．