例えば,第4章から文章をはじめたいときなど.

どうすれば良いのか?

結論:lyxに章番号専用の機能はありません.

texのコードを埋めこみましょう.

\setcounter{chapter}{1}

みたいに.

http://wiki.lyx.org/FAQ/Unsorted#toc44